上海科技大学发挥科教融合办学及教育综合改革试点单位优势，在体制机制、内部治理、教师聘任、人才培养等方面开展系列探索与实践，主动融入张江综合性国家科学中心建设，瞄准关键核心领域国际前沿和国家战略需求，开展原创性科研、培养优秀人才、推动科技成果转化。
一、面向国际科技前沿，科教融合培养关键领域紧缺高层次人才
学校在上海科创中心建设中承担了重要任务。在建的大科学设施中，上科大牵头2项、参与3项，其中硬X射线自由电子激光装置项目投资超过100亿元。学校鼓励学生参与重大科研项目和大科学设施的研制，打造了面向大科学装置集群的光子科学课程体系，开展基础性、战略性、前沿性的科学研究。持续为大科学装置定向培养紧缺人才，175名研究生参与大科学设施研制。2019年起，每年面向国内外研究生、青年科研工作者举办围绕大科学装置应用的跨学科前沿科学暑期学校，学员超过1300人。学校与牛津大学等国际知名高校开展“围绕科创中心紧缺人才”的国际联合培养计划。2016年至今，上科大培养的研究生以第一作者身份在《科学》《自然》《细胞》三大刊物发表原创性成果17篇，研究生参与的科研创新成果入选2019年度“中国生命科学十大进展” “中国高校十大科技进展”以及2020年度“中国科学十大进展”。
二、面向国家重大战略，产教融合培养关键行业应用型、复合型人才
围绕上海市三大先导产业开展产学研攻关。与高科技龙头企业共建联合实验室、实践基地，精选联影等18家尖端高科技企业合作，围绕国家“卡脖子”问题的核心技术，深度合作、联合培养研究生，坚持做精、做实，以产业和技术发展前沿需求推动学校人才培养模式改革。聘任了一批平均工作年限13年以上、教育背景和行业背景优异的行业导师，合作共建特色课程体系、开发教材，在解决行业关键共性技术难题中培养学生，服务于国家未来转型及战略产业发展。
二是持续推动创新成果不断转化为市场应用。国际《专利合作条约》（PCT）申请和外国专利占比超过1/4，专利许可率17%，许可合同金额17亿元，2018年全国高校第一，2019年全国高校第六。已转移转化的专利中，研究生参与率达51%。师生创办13家科技类公司，累计创业融资超过3亿元人民币。2019届博士毕业生参与创办的叠境公司已累计融资超1.5亿元，学生入选2020福布斯中国30岁以下精英榜。2017年，学校入选第二批国家双创示范基地，2019年入选科技部创新人才培养示范基地。以最近的2020届为例，已就业的研究生中62%在集成电路、人工智能、生物医药三大产业就业。