L'Université Tongji est l'une des universités clés sous l'administration du ministère de l’Éducation en Chine. Elle se figure sur les listes des universités chinois du premier rang dans le cadre du « Programme 211 » et du « Schéma d'action pour la promotion de l'éducation au 21ème siècle ».

L’histoire de l'Université Tongji remonte à 1907 quand l'École allemande de médecine pour les Chinois à Shanghai est fondée par le gouvernement allemand. L'école élargit son activité pour inclure le génie dans ses programmes et est renommée en École allemande de médecine et de génie. Elle a été officiellement établie en tant qu’Université en 1923. Elle est devenu Université nationale Tongji en 1927, une université complète qui offre des programmes en sciences, ingénierie, médecine, arts, et droit. En 1952, l'Université Tongji est devenue une université avec une forte orientation dans l'ingénierie, notamment en génie civil. Près de cent ans de développement a fait de l'Université de Tongji un établissement supérieur complet qui offre un large éventail de programmes en sciences, ingénierie, médecine, arts, droit, économie et gestion.

L'Université de Tongji promeut activement la coopération et les échanges avec d'autres pays. Elle a établi des liens avec l'Australie, l'Autriche, le Canada, la France, l'Allemagne, le Japon, la Suisse, le Royaume-Uni et les États-Unis dans les domaines de l'enseignement, la science, la technologie et l'économie. Les gouvernents sino-allemands ont conjointement installé une École sino-allemande et un Centre sino-allemand de formation des enseignants à Tongji. Un Institut sino-français d'ingénierie et de gestion a été établi avec le partenariat de la France. Elle a inauguré un Campus sino-italien sous l'autorisation des gouvernements chinois et italiens en 2006. Le Programme des Nations Unies pour l'environnement (UNEP) et Tongji ont conjointement établi un institut baptisé « Institut d'environnement pour le développement durable UNEP-Tongji » (IESD) en 2002. Un certain nombre de programmes conjoints ont été réalisés ces dernières années.

Tongji s'efforce de développer la formation d'étudiants étrangers. En 2011, l'université comptait 4 862 étudaints internationaux, dont la moitié inscrits aux programmes de diplôme.

L'Université Tongji compte 3 233 enseignants chercheurs, dont six membres de l'Académie chinoise des sciences, sept de l'Académie chinoise de l'ingénierie, 860 professeurs et 1 380 professeurs associés.

L'Université Tongji a 29 facultés, 74 programmes de licence, 263 programmes de master, 144 programmes de doctorat et 19 stations de recherche mobile de post-doctorat. Elle a 31 laboratoires clés et centres de recherche d'ingénierie de niveaux national et ministériel. Tongji a rassemblé les disciplines principales en conformité avec les industries locales pour établir un « groupe » et une « chaîne » : le « groupe » désigne la construction urbaine et la prévention des sinistres catastrophiques, cela regroupe des programmes tels l'architecture, la planification, la génie civil, l'énergie, l'environnement etc du campus de Siping ; la « chaîne » consiste à la fabrication moderne des équipements, cela est basée sur le Centre national d'ingénierie des moyens de transport écologiques, et regroupe des programmes tels l'automobile, le transport sur rail, la génie des systèmes de transport, la génie logiciel, la gestion, le mécanisme etc éduqués au nouveau campus de Jiading.